近日,珠江水產研究所牟希東副研究員等研發的“Fish Nuclear Protein Coding Loci Primer Evaluation Program V1.0”獲國家版權局計算機軟件著作權登記證書(證書號:軟著登字第1966059號),登記號:2017SR380775。
該系統軟件是利用國家水產種質資源共享服務平臺的魚類DNA為材料,結合已發表的多物種魚類基因組序列,尋找核基因分子標記,并用于魚類系統發育基因組學研究。本軟件的方法就是對魚類多基因組比對數據進行直系同源進化片段進行查找,將候選引物序列與同源序列進行比對,分析引物與序列間的特異性,分析引物與不同物種DNA模板序列結合的通用性。該軟件采用Python(2.7.x)編程語言開發完成,可在Linux操作系統和高性能計算集群(HPC)上運行,不僅在單臺計算機上安裝使用,而且可通過局域網絡和INTERNET進行遠程訪問使用。
