珠江所葉星研究員團隊近日完成了首張翹嘴鱖（Siniperca chuatsi）高密度遺傳連鎖圖譜的構建，并對其生長與性別性狀進行了QTL定位。
翹嘴鱖是我國重要的淡水養殖名貴魚類，年產量約30萬噸。但由于長期人工繁殖過程中忽視對親本的選育，導致種質退化，出現生長速度下降、性成熟提前與抗病力差等問題，因此急需培育快長和抗病力強的優良品種，以支撐鱖養殖業的健康可持續發展。構建遺傳連鎖圖譜對定位與抗病、生長和性別決定等重要數量性狀相關的基因與標記具有重要意義。本研究利用ddRAD-Seq技術，構建了首張翹嘴鱖遺傳連鎖圖譜。該圖譜包含3283個多態的SNP標記，分布在24個連鎖群上。圖譜總長度1972.01 cM，標記間平均間隔0.61 cM。與性別決定顯著相關的5個位點分布在同一連鎖群 (LG23) 上，它們成簇分布在LG23上的60.27-68.71cM之間。而與翹嘴鱖生長性狀顯著相關的11個QTL位點則分布在4個不同的連鎖群上。該圖譜的構建為翹嘴鱖重要性狀相關的基因與標記的進一步定位提供有價值的資源，性別相關標記的鑒定將有助于單性苗種的培育及性別決定機制的研究，并將有助于翹嘴鱖基因組序列的組裝。
相關研究論文 “Construction of a high-density linkage map and mapping of sex determination and growth-related loci in the mandarin fish (Siniperca chuatsi)” 現已被BMC Genomics錄用，并在線發表(https://bmcgenomics.biomedcentral.com/articles/10.1186/s12864-017-3830-3)。珠江所為該論文第一完成單位，孫成飛助理研究員為該論文第一作者，葉星研究員為論文通訊作者。
Figure 1. Linkage group lengths and marker distributions of the high-resolution ddRAD-based SNP linkage map of the mandarin fish. Within each linkage group, red, blue, and yellow lines represent maternal heterozygous SNPs, paternal
Figure 2. Circos diagram representing the syntenic relationships between the integrated map and the maternal map (a) or paternal map (b) of the mandarin fish. Each colored arc represents a marker match between the two maps.
Figure 3. Detection of the sex determination locus in the mandarin fish. LOD significance threshold levels were determined on the basis of 1000 permutations at a significance level of P < 0.05.
