日前，珠江水產研究所牟希東副研究員、胡隱昌研究員等研發的“Fish Nuclear Protein Coding Loci detection V1.0”獲國家版權局計算機軟件著作權登記證書，登記號：2016SR108545。
該系統軟件是以國家水產種質資源平臺為依托，利用平臺的DNA資源和全基因組數據庫資源挖掘開發的一種魚類通用型核編碼基因篩選軟件。核基因編碼基因標記（Nuclear Protein Coding Loci，NPCL）遺傳不連鎖且保守，可以較好的解決線粒體基因的不完全物種分選和堿基位點的速率差異性等問題。該軟件采用Python（2.7.x）編程語言開發完成，可在Linux操作系統和高性能計算集群（HPC）上運行，不僅在單臺計算機上安裝使用，而且可通過局域網絡和INTERNET進行遠程訪問使用。該軟件基于同源基因比對分析模型，以核編碼基因特異性和物種通用性為指標，在魚類全基因組范圍內檢測NPCL分子標記。通過深度挖掘魚類編碼基因信息，對編碼基因序列進行同源性分析，篩選出適用于NPCL分子標記設計的功能基因序列，根據同源基因保守性分析評估體系，批量化設計NPCL分子標記擴增引物。通過以上研究開發，可系統地檢測開發魚類NPCL分子標記，希望能逐步建立魚類通用型核編碼基因資源發掘和應用研究技術平臺，并應用于種質評價與鑒定、系統發育基因組學等領域。
