黿屬于國家一級水生野生保護動物，資源瀕危。珠江所龜鱉遺傳育種創新團隊自從2014年在全國率先成功開展黿人工繁育以來，積極開展黿保護生物學研究，擴大人工保種數量，不斷推進黿拯救行動計劃，為該物種野外種群恢復奠定了夯實的物質和技術基礎。
近日，龜鱉遺傳育種創新團隊在黿保護生物學研究方面取得重要進展，團隊構建了黿染色體水平上的基因組精細圖譜，在基因組水平上發現了與腫瘤抑制、生長和年齡相關基因候選基因發生了擴張，進化分析發現龜鱉的RSCU值相較于其它脊椎動物處于中間水平。基于建立的黿參考基因組，構建了冬眠前后外周血單細胞圖譜，發現并區分了正常狀態和休眠期的細胞類型，為每個細胞亞群識別了一系列標記基因，確定了與應激反應相關的基因，為更好地解析冬眠的適應機制奠定了基礎。針對黿野外資源調查困難的現狀，開發了基于線粒體ND5基因的黿環境DNA檢測技術，并在野外水域得到了應用，為黿野外資源調查和放流效果評估提供了新的思路和輔助方法。圍繞以姿勢-動作-環境為中心，以生態功能為依據，構建并開展了人工培育下幼黿的PAE行為譜等方面的行為學研究。系列研究為深入開展黿保護生物學研究奠定了理論基礎，為人工馴養管理及放流提供技術支撐。
相關研究成果以5篇論文的形式呈現。分別為“A chromosome-level genome assembly of the Asian giant softshell turtlePelochelys cantorii”發表于Scientific data, 2023, 10:754 (IF=9.8, JCR1區)，洪孝友助理研究員為第一作者，朱新平研究員和劉曉莉助理研究員為共同通訊作者；“Single-cell atlas reveals the hemocyte subpopulations and stress responses in Asian giant softshell turtle during hibernation”發表于Biology, 2023, 12:994 (IF=4.2, JCR2區)，洪孝友為第一作者，朱新平和劉曉莉為共同通訊作者；“Chromosome-level analysis of thePelochelys cantoriigenome provides insights to its immunity, growth and longevity”發表于Biology, 2023, 12:939 (IF=4.2, JCR2區)，劉曉莉為第一作者，朱新平和洪孝友為共同通訊作者；“Exploring the relationship between environmental DNA concentration and biomass in Asian giant softshell turtle (Pelochelys cantorii)”發表于PeerJ, 2023, 11:e16218 (IF=2.7, JCR2區)，洪孝友和研究生王開闊為第一作者，朱新平為通訊作者；“Behavior coding and ethogram of juvenile domesticated Asiangiant softshell turtles,Pelochelys cantorii”發表于Russian Journal of Herpetology, 2023, 30(3) (IF=0.7, JCR4區)，洪孝友為第一作者，朱新平為通訊作者。上述研究成果得到國家重點研發計劃藍色糧倉重點專項、中國-東盟聯合基金、廣東省自然基金面上項目、廣州市科技計劃重點項目、中國水產科學研究院珠江水產研究所基本科研業務費、農業農村部政府購買服務項目和廣東農業農村廳一般性轉移項目等的資助。
圖1黿染色體水平基因組情況
圖2黿的外周血細胞冬眠前后的單細胞圖譜
圖3不同地區黿ND5引物擴增片段與對比
圖4幼黿捕食行為
