近日，珠江水產(chǎn)研究所珠江漁業(yè)資源調(diào)查與評估創(chuàng)新團(tuán)隊在國際學(xué)術(shù)刊物《GENE》發(fā)表了題為“Whole-genome resequencing confirms the genetic effects of dams on an endangered fishHemibagrus guttatus(Siluriformes: Bagridae): A case study in a tributary of the Pearl River”的研究論文。該研究得到廣東基礎(chǔ)和應(yīng)用基礎(chǔ)科學(xué)基金資助項目（2020A1515110252）的資助。珠江所為論文第一完成單位，陳蔚濤副研究員為論文的第一作者，李捷研究員為論文的通訊作者。
梯級水壩引起的生境破碎化會導(dǎo)致基因漂變、近親繁殖、瓶頸效應(yīng)等，從而降低魚類的種群遺傳多樣性，增加隔離種群的遺傳分化。珠江水系梯級開發(fā)嚴(yán)重，給漁業(yè)資源的可持續(xù)發(fā)展造成了巨大的威脅。然而，珠江水系梯級開發(fā)對魚類影響的相關(guān)研究相當(dāng)匱乏，在遺傳層面上更是一片空白，這極大阻礙了梯級開發(fā)背景下魚類的保護(hù)和管理策略的制定。本研究選擇北江支流連江珍稀瀕危物種斑鳠為研究對象，測定了6個梯級隔離群體的全基因組重測序數(shù)據(jù)，綜合系統(tǒng)發(fā)育構(gòu)建、遺傳群體分析、離群位點分析等方法，發(fā)現(xiàn)所有研究群體都呈現(xiàn)出較低的核苷酸多樣性與有效種群大小以及較高的Tajima’sD值和近交系數(shù)，表明梯級開發(fā)可能影響了連江斑鳠群體的遺傳多樣性和有效種群規(guī)模，并且這些群體可能受到了遺傳漂變與頻繁近交的影響，其中梯級大壩最上游的連州群體影響最為嚴(yán)重，甚至形成了相對獨立的遺傳種質(zhì)背景。與此同時，分析發(fā)現(xiàn)不同隔離群體之間在核基因組水平和線粒體基因組水平上都存在顯著的遺傳分化，暗示梯級大壩可能限制了它們之間的基因交流。本研究從基因組視角找到了梯級開發(fā)對瀕危物種斑鳠遺傳多樣性與遺傳結(jié)構(gòu)影響的一些證據(jù)，為梯級開發(fā)情景下該物種的保護(hù)提供了重要啟示。
論文鏈接：https://doi.org/10.1016/j.gene.2023.148000
