鱖魚是我國重要的淡水優質魚類，也是我國漁業轉方式、調結構的首選品種之一。解決鱖魚攝食活餌養殖成本高、生長速度下降、成活率低、病害頻發等問題成為鱖魚新品種培育的重要方向。因此，利用高效的現代分子育種技術，研發創制基因芯片，對開展鱖魚選育具有重要意義。
中國水產科學研究院珠江水產研究所鱖鱸基因組學與選擇育種創新團隊與華智生物技術有限公司合作，利用cGPS（Genotyping by Pinpoint Sequencing of captured targets）靶向測序技術，研發了具有自主知識產權的首個鱖魚40K液相育種芯片“鱖芯1號”。該芯片可應用于鱖魚種質資源鑒定、遺傳多樣性評估、基因定位與挖掘鑒定、全基因組關聯分析、分子輔助定向改良和智能育種等不同場景，為鱖魚遺傳研究和品種選育提供了高效基因型鑒定工具。利用該芯片可篩選獲得優良性狀的鱖魚新品種，還將進一步降低選育成本，助力鱖魚全基因組選育和良種創新研究。
該芯片位點多態性高、基因組分布均勻，位點在染色體上的平均覆蓋率為99.87%，平均間距17Kb。性狀關聯位點豐富，芯片包括團隊前期研究篩選獲得的鱖魚馴食、性別和生長性狀關聯的分子標記554個，可用于生長、性別和馴食等重要性狀的精準鑒定和挖掘利用。芯片技術參數優良，平均位點檢出率為99.35%，重復樣本基因型平均一致率為99.51%，與重測序樣本基因型比對平均一致率為99.11%。芯片整體性能優良，穩定性好，基因型準確度高。
負責“鱖芯1號”研發的核心成員包括團隊負責人孫成飛副研究員、葉星研究員、董浚鍵助理研究員等。更多相關訊息詳見https://mp.weixin.qq.com/s/j4F_9Uufw9d7mSOGwUmzNQ。
圖1 鱖魚40K cGPS液相育種芯片檢測試劑盒
圖2 鱖魚40K cGPS液相育種芯片標記位點在染色體上的分布
圖3 “鱖芯1號”的檢測效果
